"Å styrelsens vägnar vill jag tacka Stephen för allt han har åstadkommit på Abrdn under de senaste fyra åren", säger styrelseordförande Douglas Flint.
"Han kom till oss när pandemin slog till och trots de restriktioner som detta medförde gick han i spetsen för en grundläggande omformning av företaget och ledde från fronten för att skapa ett företag som kan vara konkurrenskraftigt i en snabbt föränderlig sektor."
Windsor blev finanschef på kapitalförvaltaren så sent som förra sommaren.
I det första kvartalet uppgick Arbdns genomsnittliga förvaltade och administrerade kapital (AUMA) till 507,7 miljarder pund. De totala nettoinflödena uppgick till 0,8 miljarder pund. Enligt bolaget har utvecklingen och nettoinflödena under Q2 visat liknande trender som under Q1.